La fuente de material genético será a partir de semillas o propagulos provenientes de una población de Rhizphora mangle, ubicada en el paraje El Playón, cercano al área afectada dentro de la misma Reserva de la Biosfera.

Núñez (1997) estudiaron que esta población se encuentra estable, además de que se está regenerando naturalmente. Para esto será necesaria la recolección de las plántulas directamente de la planta madre. La madurez de dichos frutos es evidente ya que deben presentar una coloración café oscuro, será transportados en viveros en bolsas con agua para evitar la desecación.

Debido al nivel de endogamia de manera natural, se propone la selección recolección del material genético de diferentes árboles padre.

También se ha considerado realizar la selección de masas poblacionales cercanas al área afectada.